前列腺囊肿是由于前列腺腺体先天性或后天性原因而发生囊样改变。先天性囊肿为副肾管退化不全，在正中线融合，膀胱下形成一个很深的憩室或囊肿，开口于前列腺尿道的后方。后天性囊肿系由坚韧的前列腺基质导致腺泡不完全或间断性梗阻，逐渐使腺泡上皮变厚，终至发生潴留性囊肿，可位于前列腺内的任何部位或突出至膀胱颈部，直径为1～2厘米。
温州东瓯男科医院医生表示：前列腺囊肿的病因主要有以下几方面：
1、前列腺充血：各种不同原因引起的充血特别是被动充血，是前列腺炎的重要致病因素。生活中引起充血的情形很常见：房事不正常、会阴部受挤压、酗酒、贪食油腻食物、按摩过重和感冒受凉等。
2、尿液：尿液中含有多种酸碱性化学物质，当病人局部神经内分泌失调，引起后尿道压力过高、前列腺管开口处损伤时，就会造成尿酸等性化学物质返流进入前列腺内，诱发前列腺炎。
3、病原微生物感染：各种微生物如细菌、原虫、真菌、病毒等都可成为致前列腺炎的感染源，其中又以细菌为常见。
